J-OCTAの主な機能
ズーミング機能、リバースマッピング機能
- 平均場法によって得られた成分分布を用いて分子動力学の構造を作成することが出来ます。
- 粗視化分子動力学によって得られた分子構造を用いて、全原子分子動力学の構造を作成することが出来ます。
- 全原子モデルのみでは困難な、緩和された分子構造を作成することが可能になります。
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粗視化モデルでの一軸伸長と 全原子モデルへのリバースマッピング |
SUSHI(平均場法)の体積分率分布を用いた 粗視化分子の生成 |