分子動力学エンジン「COGNAC」を用いることで、ポリマーのガラス転移温度Tgを評価することができます。具体的には、系を高温に設定した状態から温度を一定間隔で下げていき（クエンチ）、系の体積変化を評価していきます。結果的に、体積変化の屈曲点が現れれば、その温度がガラス転移点温度となります。

  アモルファス状態のポリマーのデータを用いて、ガラス転移点温度を評価しました。図2はアモルファス状態のポリエチレンにおける、系の比体積の温度変化の様子を示します。体積変化の様子が明確に変わる温度を有しており、これをガラス転移点として評価しました。